1、MyISAM不支持事务，InnoDB是事务类型的存储引擎，当我们的表需要用到事务支持的时候，那肯定是不能选择MyISAM了。
2、MyISAM只支持表级锁，而InnoDB支持行级锁和表级锁默认为行级锁
表级锁：直接锁定整张表，在锁定期间，其他进程无法对该表进行写操作，如果设置的是写锁，那么其他进程读也不允许 MyISAM是表级锁定的存储引擎，它不会出现死锁问题 对于write，表锁定原理如下： 如果表上没有锁，在其上面放置一个写锁，否则，把锁定请求放在写锁队列中。 对于read，表锁定原理如下 ： 如果表上没有写锁定，那么把一个读锁放在其上面，否则把锁请求放在读锁定队列中 当一个锁定被释放时，表可被写锁定队列中的线程得到，然后才是读锁定队列中的线程。这意味着，如果你在一个表上有许多更新，那么你的SELECT语句将等到所有的写锁定线程执行完。 行级锁：只对指定的行进行锁定，其他进程还是可以对表中的其他行进行操作的。 行级锁是Mysql粒度最小的一种锁，它能大大的减少数据库操作的冲突，但是粒度越小实现成本也越大。 行级锁可能会导致“死锁”，那到底是怎么导致的呢，分析原因：Mysql行级锁并不是直接锁记录，而是锁索引。索引分为主键索引和非主键索引两种，如果一条sql语句操作了主键索引，那么Mysql就会锁定这个主键索引，如果sql语句操作的是非主键索引，那么Mysql会先锁定这个非主键索引，再去锁定主键索引。 在UPDATE 和 DELETE操作时Mysql不仅会锁定所有WHERE 条件扫描过得索引，还会锁定相邻的键值。 “死锁”举例分析： 表Test：（ID,STATE,TIME） 主键索引：ID 非主键索引：STATE 当执行"UPDATE STATE =1011 WHERE STATE=1000" 语句的时候会锁定STATE索引，由于STATE 是非主键索引,所以Mysql还会去请求锁定ID索引 当另一个SQL语句与语句1几乎同时执行时：“UPDATE STATE=1010 WHERE ID=1” 对于语句2 Mysql会先锁定ID索引，由于语句2操作了STATE字段，所以Mysql还会请求锁定STATE索引。这时。彼此锁定着对方需要的索引，又都在等待对方释放锁定。所以出现了"死锁"的情况。 行级锁的优点： 有许多线程访问不同的行时，只存在少量的冲突。 回滚时只有少量的更改 可以长时间锁定单一的行 行级锁缺点： 相对于页级锁和表级锁来说占用了更多的内存 当表的大部分行在使用时，比页级锁和表级锁慢，因为你必须获得更多的锁 当在大部分数据上经常使用GROUP BY操作，肯定会比表级锁和页级锁慢。 页级锁：表级锁速度快，但是冲突多；行级锁速度慢，但冲突少；页级锁就是他俩折中的，一次锁定相邻的一组记录。3、MyISAM引擎不支持外键，InnoDB支持外键
4、MyISAM引擎的表在大量高并发的读写下会经常出现表损坏的情况
我们以前做的项目就遇到这个问题，表的INSERT 和 UPDATE操作很频繁，原来用的MyISAM引擎，导致表隔三差五就损坏，后来更换成了InnoDB引擎。 其他容易导致表损坏原因： 服务器突然断电导致数据文件损坏，强制关机（mysqld未关闭情况下）导致表损坏 mysqld进程在写入操作的时候被杀掉 磁盘故障 表损坏常见症状： 查询表不能返回数据或返回部分数据 打开表失败： Can’t open file: ‘×××.MYI’ (errno: 145) 。 Error: Table 'p' is marked as crashed and should be repaired 。 Incorrect key file for table: '...'. Try to repair it Mysql表的恢复： 对于MyISAM表的恢复： 可以使用Mysql自带的myisamchk工具： myisamchk -r tablename 或者 myisamchk -o tablename（比前面的更保险） 对表进行修复5、对于count()查询来说MyISAM更有优势
因为MyISAM存储了表中的行数记录，执行SELECT COUNT() 的时候可以直接获取到结果，而InnoDB需要扫描全部数据后得到结果。 但是注意一点：对于带有WHERE 条件的 SELECT COUNT()语句两种引擎的表执行过程是一样的，都需要扫描全部数据后得到结果6、 InnoDB是为处理巨大数据量时的最大性能设计，它的CPU效率可能是任何其它基于磁盘的关系数据库引擎所不能匹敌的。
7、MyISAM支持全文索引（FULLTEXT），InnoDB不支持（5.6以后支持全文索引）
8、MyISAM引擎的表的查询、更新、插入的效率要比InnoDB高
网上截取了前辈们测试结论：
测试方法：连续提交10个query， 表记录总数：38万 ， 时间单位 s
引擎类型MyISAMInnoDB性能相差count0.00083573.01633609查询主键0.0057080.157427.57查询非主键24.0180.373.348更新主键0.0081240.8183100.7更新非主键0.0041410.026256.338插入0.0041880.369488.21 （1）加了索引以后，对于MyISAM查询可以加快：4 206.09733倍，对InnoDB查询加快510.72921倍，同时对MyISAM更新速度减慢为原来的1/2，InnoDB的更 新速度减慢为原来的1/30。要看情况决定是否要加索引，比如不查询的log表，不要做任何的索引。（2）如果你的数据量是百万级别的，并且没有任何的事务处理，那么用MyISAM是性能最好的选择。（3）InnoDB表的大小更加的大，用MyISAM可省很多的硬盘空间。在我们测试的这个38w的表中，表占用空间的情况如下：
引擎类型MyISAMInnoDB数据53,924 KB58,976 KB索引13,640 KB21,072 KB占用总空间67,564 KB80,048 KB另外一个176W万记录的表， 表占用空间的情况如下：
引擎类型MyISAMInnoDB数据56,166 KB90,736 KB索引67,103 KB88,848 KB占用总空间123,269 KB179,584 KB