迁移Zabbix数据库到TokuDB

    xiaoxiao2021-08-20  241

    背景介绍线上的Zabbix数据库有几个大表数据量疯狂增长,单表已经超过500G,而且在早期也没做成分区表,后期维护非常麻烦。比如,想删除过期的历史数据,在原先的模式下,history、history_uint等几个大表是用 (itemid, clock) 两个字段做的联合主键,只用 clock 字段检索效率非常差。

    TokuDB 是一个高性能、支持事务处理的 MySQL 和 MariaDB 的存储引擎。TokuDB 的主要特点是高压缩比,高 INSERT 性能,支持大多数在线修改索引、添加字段,特别适合像 Zabbix 这种高 INSERT,少 UPDATE 的应用场景。

    迁移准备欲使用 TokuDB 引擎,服务层可以选择和 MariaDB ,也可以选择 Percona ,鉴于我以往使用 Percona 的较多,因此本次也选择使用 Percona 版本集成 TokuDB 引擎。

    当前最新版下载地址:http://www.percona.com/redir/downloads/Percona-Server-5.6/LATEST/binary/tarball/Percona-Server-5.6.17-rel66.0-608.TokuDB.Linux.x86_64.tar.gz

    按照正常方式安装即可,配置文件中增加3行:

    malloc-lib= /usr/local/mysql/lib/mysql/libjemalloc.so plugin-dir = /usr/local/mysql/lib/mysql/plugin/ plugin-load=ha_tokudb.so 如果不加载jemalloc,启动时就会有类似下面的报错: [ERROR] TokuDB not initialized because jemalloc is not loaded [ERROR] Plugin 'TokuDB' init function returned error. [ERROR] Plugin 'TokuDB' registration as a STORAGE ENGINE failed. 并且,修改内核配置,禁用transparent_hugepage,不关闭的话可能会导致TokuDB内存泄露(建议写到 /etc/rc.local 中,重启后仍可生效): echo never > /sys/kernel/mm/redhat_transparent_hugepage/defrag echo never > /sys/kernel/mm/redhat_transparent_hugepage/enabled echo never > /sys/kernel/mm/transparent_hugepage/enabled echo never > /sys/kernel/mm/transparent_hugepage/defrag 如果不修改内核设置,启动时就会有类似下面的报错: Transparent huge pages are enabled, according to /sys/kernel/mm/redhat_transparent_hugepage/enabled Transparent huge pages are enabled, according to /sys/kernel/mm/transparent_hugepage/enabled [ERROR] TokuDB will not run with transparent huge pages enabled. [ERROR] Please disable them to continue. [ERROR](echo never > /sys/kernel/mm/transparent_hugepage/enabled) [ERROR] [ERROR] ************************************************************ [ERROR] Plugin 'TokuDB' init function returned error. [ERROR] Plugin 'TokuDB' registration as a STORAGE ENGINE failed.

    然后,初始化数据库,启动即可。

    我的服务器配置:E5-2620 * 2,64G内存,1T可用磁盘空间(建议datadir所在分区设置为xfs文件系统),下面是我使用的相关选项,仅供参考:

    # # my.cnf # # Percona-5.6.17, TokuDB-7.1.6,用于Zabbix数据库参考配置 # 我的服务器配置:E5-2620 * 2,64G内存,1T可用磁盘空间(建议datadir所在分区设置为xfs文件系统) # TokuDB版本:Percona-5.6.17, TokuDB-7.1.6(插件加载模式) # # created by yejr(http://imysql.com), 2014/06/24 # [client] port = 3306 socket = mysql.sock #default-character-set=utf8 [mysql] prompt="\\u@\\h \\D \\R:\\m:\\s [\\d]> #pager="less -i -n -S" tee=/home/mysql/query.log no-auto-rehash [mysqld] open_files_limit = 8192 max_connect_errors = 100000 #buffer & cache table_open_cache = 2048 table_definition_cache = 2048 max_heap_table_size = 96M sort_buffer_size = 2M join_buffer_size = 2M tmp_table_size = 96M key_buffer_size = 8M read_buffer_size = 2M read_rnd_buffer_size = 16M bulk_insert_buffer_size = 32M #innodb #只有部分小表保留InnoDB引擎,因此InnoDB Buffer Pool设置为1G基本上够了 innodb_buffer_pool_size = 1G innodb_buffer_pool_instances = 1 innodb_data_file_path = ibdata1:1G:autoextend innodb_flush_log_at_trx_commit = 1 innodb_log_buffer_size = 64M innodb_log_file_size = 256M innodb_log_files_in_group = 2 innodb_file_per_table = 1 innodb_status_file = 1 transaction_isolation = READ-COMMITTED innodb_flush_method = O_DIRECT #tokudb malloc-lib= /usr/local/mysql/lib/mysql/libjemalloc.so plugin-dir = /usr/local/mysql/lib/mysql/plugin/ plugin-load=ha_tokudb.so #把TokuDB datadir以及logdir和MySQL的datadir分开,美观点,也可以不分开,注释掉本行以及下面2行即可 tokudb-data-dir = /data/mysql/zabbix_3306/tokudbData tokudb-log-dir = /data/mysql/zabbix_3306/tokudbLog #TokuDB的行模式,建议用 FAST 就足够了,如果磁盘空间很紧张,建议用 SMALL #tokudb_row_format = tokudb_small tokudb_row_format = tokudb_fast tokudb_cache_size = 44G #其他大部分配置其实可以不用修改的,只需要几个关键配置即可 tokudb_commit_sync = 0 tokudb_directio = 1 tokudb_read_block_size = 128K tokudb_read_buf_size = 128K

    迁移过程建议在一台全新的服务器上启动Percona(TokuDB)实例进程,初始化新的Zabbix数据库,直接将大表转成TokuDB引擎,并且开启分区模式。这样相比直接在线ALTER TABLE或者INSERT…SELECT导入数据都要来的快一些(我简单测试了下,差不多能快2-3倍,甚至更高)。

    在做数据迁移时,建议在目标服务器上做库表结构初始化,在源服务器上采用分段方式导出,一个表导出多个备份文件,方便在恢复时可以并发导入。在导入时,并且记得临时关闭 binlog,最起码设置sync_binlog = 0 以及tokudb_commit_sync = 0,以提高导入速度。采用 mysqldump增加 -w 参数即可实现根据条件分段导出,具体可参考上一次的文章:[MySQLFAQ]系列— mysqldump加-w参数备份,或者是用MySQLDumper。

    需要用到外键的表继续保留InnoDB引擎,其他表都可以转成TokuDB,history_str、trends、trends_uint、history、history_uint等几个大表是一定要转成TokuDB的,events由于需要用到外键,所以继续保留InnoDB引擎。

    我将表结构初始化SQL脚本提供下载了,一份是没有采用分区表的,一份是采用分区表的,大家可自行选择。一般如果记录数超过1亿,就建议使用分区表,根据时间字段(clock)分区,方便后期维护,例如删除过期历史数据什么的。收尾剩下的基本没啥可做的了,就是观察下运行状态,是否还有个别慢查询堵塞。在我的环境中,一开始把items表也转成TokuDB了,结果有个画图的SQL执行计划不准确,非常慢。后来发现items表也需要用到外键,于是又转回InnoDB表,这个SQL也恢复正常了。

    数据库初始化脚本我整理后提供下载了,大家可以在PC端打开原文链接下载使用。Zabbix版本:Zabbix 2.2.0TokuDB版本:Percona-5.6.17, TokuDB-7.1.6(插件加载模式)

    关于MySQL的方方面面大家想了解什么,可以直接留言回复,我会从中选择一些热门话题进行分享。 同时希望大家多多转发,多一些阅读量是老叶继续努力分享的绝佳助力,谢谢大家 :)

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    文章转自老叶茶馆公众号,原文链接:https://mp.weixin.qq.com/s/BqLwjQNtxUFWzumsbgmeFA


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